A Comissão Nacional de Avaliação da Educação Superior, conhecida como Conaes, é o órgão colegiado de coordenação e supervisão do Sinaes. É papel da Conaes propor e elaborar mecanismos de avaliação, bem como formular propostas de desenvolvimento das instituições e realizar as reuniões convocadas pelo Ministro de Estado de Educação.